ツール → メッセージフィルタを選択します。

新規 を選択します。

迷惑メールの判定をされると [SPAM] というものが件名に付加されるので
こちらを振り分ける設定をします。

フィルタ名	任意の名前を入力してください。
新着メール受信時	チェックを入れてください。
条件の設定	1.すべての条件に一致にチェック。 2.「件名」「に次を含む」を選択。 3.入力欄に「[SPAM]」と入力。
以下の動作を実行する	1.「メッセージを移動する」を選択。 2.迷惑メールを振り分けたいフォルダを選択。 (※モザイク部分)

入力が終わったらOKを選択してください。

フィルタ名に設定した項目が表示され、有効にチェックが入っていることを確認したら設定完了です。